賀建奎,南方科技大學副教授。主要研究實驗室用物理,統計和信息學的交叉技術來研究複雜的生物系統。研究集中於免疫組庫測序,個體化醫療,生物信息學系統生物學

賀建奎實驗室將高通量測序套用到免疫細胞受體庫的多樣性研究。

個人成就

他主要的研究成果為複雜網路的模組和分級結構以及流感疫苗的設計。

他關於模組進化的工作被美國先進科學協會SWARM分會(AAAS-SWARM)評為2010年傑出論文。

賀建奎本科畢業於中國科技大學,後留學美國,在萊斯大學獲博士學位。

賀建奎實驗室用物理,統計和信息學的交叉技術來研究複雜的生物系統。

主要的研究集中於免疫基因組學,個體化醫療,生物信息學和系統生物學。

賀建奎實驗室將高通量測序套用到免疫細胞受體庫的多樣性研究。

研究領域

免疫組庫

免疫組庫測序技術(immune repertoire sequencing)能一次性從一個樣本中測出上百萬個T細胞受體和B細胞抗體分子的基因序列,從而提供一個全面的和準確的免疫系統狀態的描述。

免疫組庫測序技術自2009年在美國史丹福大學開發出來後迅速廣泛套用在臨床和基礎科研中。

賀建奎實驗室運用此技術來研究腫瘤浸潤T細胞,從中挑選出有效的T細胞作為開發腫瘤疫苗的新方法;通過對自身免疫性疾病的大範圍的篩查,找出導致自身免疫的T細胞或者抗體,作為藥物開發和治療的靶點。

單細胞基因組研究

每一個細胞都是獨一無二的。

賀建奎實驗室對單個細胞的基因組和轉錄組進行高通量測序研究,以揭示腫瘤細胞的多樣性,胚胎早期發育的分化和神經元細胞的差異。

個體化醫療生物信息學

賀建奎實驗室開發的"個人基因組解碼器軟體群"是一系列解讀個人基因組中健康信息的軟體群,包含的重大疾病風險預測,先天性遺傳病攜帶分析,藥物反應相關基因篩查。

賀建奎實驗室設計了具有自主智慧財產權的全遺傳病基因晶片,並開始廣泛用於臨床和產業化。

教育經歷

2011年,美國史丹福大學博士後

2010年,獲得美國萊斯大學生物物理學博士學位;

2006年,獲得中國科學技術大學近代物理學學士學位。

代表文章

1. Ning Jiang, Jiankui He (co-first author), Joshua A. Weinstein, Lolita Penland, Sanae Sasaki, Xiao-Song He, Cornelia L. Dekker, Patrick C. Wilson, Harry B. Greenberg, Mark M. Davis, Daniel S. Fisher and Stephen R. Quake (2013), High Throughput Sequencing of the Human Immune Repertoire in Response to Influenza Vaccination. Science Translational Medicine, 171ra19

2. J. He and M. Deem (2010), "Heterogeneous Diversity of Spacers within CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)" Phys. Rev. Lett. 105:128102

3. J. He and M. Deem (2010) "Structure and response in the world trade network." Phys. Rev. Lett. 105:198701

4. J. He and M. Deem (2010) "Low-dimensional clustering detects incipient dominant influenza strain clusters." Protein Engineering Design and Selection 23:935–946

5. J. He and M. Deem (2010) "Hierarchical evolution of animal body plans." Developmental Biology, 337:157

6. J. He, J. Sun and M. Deem (2009) "Spontaneous emergence of modularity in a model of evolving individuals and in real networks." Phys. Rev. E. 79: 031907. Also in Virtual Journal of Biological Physics Research

7. J. He, Q. Chen, L. Ding and S. Wan (2008) "Conclusive and perfect quantum state transfer with a single spin chain." Phys. Lett. A 372:185-190

個人專著

1. Jiankui He (2011) "Modularity: The principle of evolution in complex systems" Lambert Academic Publishing, Koln, Germany. 2011